Jean-Paul Mazoyer commence sa carrière au Crédit Lyonnais Suisse en 1988, puis chez Accenture où il effectue, de 1989 à 1996, différentes missions de conseil auprès de banques, notamment le Crédit Agricole. En 1996, il rejoint la Direction marketing des particuliers de la Caisse Nationale de Crédit Agricole. En 1998, il devient Directeur du marketing et de la communication du Crédit Agricole Ile-de-France. En 2002, il est nommé Directeur des Crédits et des Risques. Jean-Paul Mazoyer rejoint Calyon (désormais CACIB) en 2004, comme Directeur adjoint du Réseau International, en charge de la coordination et de l’animation de l’ensemble des fonctions supports. En 2007, il devient Directeur des Fonctions Supports et Développement de Crédit Agricole Asset Management (marketing, support commercial et réseau international), puis en 2010, Jean-Paul Mazoyer est nommé Directeur général délégué d’Amundi, après avoir piloté le processus de rapprochement entre CAAM et SGAM. En 2013, il devient Directeur Informatique et Industriel Groupe de Crédit Agricole S.A. De début 2016 à mi-2020 Jean-Paul Mazoyer a été Directeur général du Crédit Agricole Pyrénées Gascogne.

Jean-Paul Mazoyer est diplômé de l’EM Lyon (1987) et de l’Institut des Hautes Études de la Défense Nationale (2015).